1、C18柱C18色谱柱是最常用、每个试验室必备的通用型色谱柱。填料是硅胶基质上键合十八烷基，有较高的碳含量和较好的疏水性，适用于大多数化合物，包含非极性、极性小分子及一些多肽及蛋白质。跟着每家色谱柱制造商的研制，C18柱的类型还在继续不断的添加。适用pH规模由本来的2～8，开展到现在1～14，与纯水相的兼容性渐渐的变好，某些色谱柱即便长期运用100%水相，也不可能会产生填料疏水陷落。关于每位试验人员来说，可供挑选的规模日趋广泛。
2、苯基柱苯基柱与C18柱类似，是在硅烷基上键合一个苯环。这造成了关于有些特别的化合物(如芳香族化合物)在反相保存时与C18有不同的挑选性。在某些条件下，可以将C18无法别离的化合物别离。
3、五氟苯基柱五氟苯基柱的填料颗粒是硅烷基上键合一个五氟苯基。与惯例的C18保存机制类似，但供给了不同的别离挑选性，进步了对极性样品的保存，特别是对卤族化合物。
4、氨基柱氨基柱是在硅胶的硅羟基上键合了酰胺基，归于HILIC形式的色谱柱，其保存机制很杂乱，首要是液液分配、吸附效果、离子相互效果和亲水性保存效果的多形式组合。大多数都用在剖析极性大的化合物，还合适用于糖类化合物的剖析，如1，5一脱水葡萄糖醇。首要的长处是可以正常的运用高有机相剖析反相保存弱的化合物，对质谱离子化有更好的兼容性，进步检测灵敏度。
5、裸硅胶柱未杂化的硅胶颗粒色谱柱在日常的剖析中也常用于液相色谱一质谱联用办法，硅胶柱与氨基柱有类似的保存基质及长处，同属HILIC形式的色谱柱。大多数都用在极性化合物的剖析，特别是强极性碱性水溶性化合物，如生物碱、肾上腺素系列。
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